Молекулярни биолози от Института Гладстон са измислили нов начин за разшифроване на ДНК, който ще позволи да се определи как "тъмната материя" на генома – участъците, които не кодират белтъци – влияе върху гените и като следствие определя генетичното здраве на човека. Изследването е публикувано в сп. Nature Genetics, съобщава Lenta.ru.
В своята работа учените са изследвали т.нар. енхансери – участъци от ДНК, които се свързват с определени молекули и са способни да изменят активността на всеки ген. Самите тези участъци, за разлика от гените, не кодират белтъци, но се явяват един вид инструкции, които казват на гена при какви условия трябва да усили своята работа.
Според Катрин Полард, водещ автор на изследването, повечето генетични мутации, които могат да предизвикат сериозни заболявания протичат именно в енхансерите. Но опитите да се изследва как именно енхансерът влияе върху гена, се натъквали на сериозни проблеми.
Първоначално учените смятали, че енхансерът влияе върху гена, който се намира в непосредствена близост до него, което много би опростило задачата. Но сега е известно, че енхансерът и зависимият от него ген могат да бъдат отделени от милиони нуклеотиди и енхансерът, който влияе на интересуващия ни ген, може да е разположен на произволно място.
За да решат този проблем, учените са анализирали огромни масиви данни по геномите на шест типа клетки. Те търсели закономерности в генома, обуславящи взаимодействието между гена и енхансера. Биолозите успели да открият няколко специфични участъка от ДНК, които се разполагат на местата, съединяващи енхансерите с гените.
Новият метод за търсене на подобни участъци в други места на генома, наречен TargetFinder, ще позволи на учените да откриват нови двойки ген-енхансер с точност до 85%.
Програмният код TargetFinder и данните на биолозите са достъпни безплатно в интернет.
